巳田
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銀成高校の教師。正体は蛇型のホムンクルスで、殺したはずのカズキが核鉄によって蘇っていたため、再度カズキを始末しようとするが、武装錬金が可能となったカズキのサンライトハートで貫かれ死亡した。
猿渡
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蝶野が生み出したマウンテンゴリラのホムンクルス。廃工場で子分を率いて斗貴子と戦うが、斗貴子に子分を倒された上、駆けつけたカズキのサンライトハートで貫かれ死亡した。
蛙井
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蝶野に生み出されたコモリガエルのホムンクルス。カズキと交戦し、飾り布の特性を理解したカズキに敗れる。そこに現れた花房によってカズキが戦闘不能にさせられるも、主への造反を花房に見抜かれとどめを刺された。
花房
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蝶野が生み出したバラのホムンクルス。蛙井始末後、戦闘不能となったカズキを始末しようとするが、駆けつけた斗貴子と交戦。斗貴子のバルキリースカートで頭を吹き飛ばされ死亡した。
鷲尾
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蝶野が生み出したオオワシのホムンクルス。蝶野の計画を阻止しようとするカズキと斗貴子の前に立ちはだかり二人と交戦。蝶野が生み出した最高傑作としてカズキと斗貴子を追い詰めるが、二人の連携によって片翼を失っていく。カズキが布をサンライトハートの穂先に巻き、繰り出してきたエネルギー全開のジュースティングクラッシャーに敗れ死亡した。
蝶野次郎
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蝶野攻爵の弟。蝶野が作るホムンクルス完成直前に蝶野の前に現れ、蝶野の病が治るのを阻止するためにホムンクルスを破壊。が、蝶野の呼びかけに応じてホムンクルスが蝶野と融合し、ホムンクルスとなった蝶野に吸収され死亡した。
蝶野刺爵
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蝶野攻爵の父親。蝶野がホムンクルス化した際に「オレと次郎と見分けがついた者は助けてやろう」と決め、刺爵は次郎だと思ってしまったため吸収され死亡した。
金城
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LXEのホムンクルスの一人。蝶野の尾行をし、蝶野が学校の屋上でカズキらに宣戦布告した後に姿を現し、ブラボーと交戦。ブラボーに敗れると情報を漏らさないようにするべく、舌を噛み切って自害しようとするがホムンクルスであるゆえ死ねず、陣内が代わりに口封じのためにムチで体を貫いていき死亡した。
陣内
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LXEのホムンクルスの一人。ノイズィハーメルンで宿舎の生徒を操り斗貴子の核鉄を奪おうとするも、斗貴子に返り討ちにされ体をバラバラにされた末に惨殺された。