作中で死んでしまうキャラクター
メラミ=ゴールドマイン
世界探偵機構の超探偵。カナイ区へ向かうアマテラス列車の中で、睡眠薬入りの飲み物を飲み眠ってしまい、その間にジルチに焼き殺された。
プッチー=ラヴミン
世界探偵機構の超探偵。カナイ区へ向かうアマテラス列車の中で、睡眠薬入りの飲み物を飲み眠ってしまい、その間にジルチに焼き殺された。
ザンゲ=イレイザー
世界探偵機構の超探偵。カナイ区へ向かうアマテラス列車の中で、睡眠薬入りの飲み物を飲み眠ってしまい、その間にジルチに焼き殺された。
エイフェックス=ローガン
世界探偵機構の超探偵。カナイ区へ向かうアマテラス列車の中で、睡眠薬入りの飲み物を飲み眠ってしまい、その間にジルチに焼き殺された。
ジルチ=アレクサンダー
世界探偵機構の超探偵に扮したアマテラス社のスパイ。カナイ区に向かうアマテラス列車の中で飲み物に睡眠薬を混ぜ、飲んだ超探偵たちを眠らせ次々に焼死させていく。自身も殺されたふりをしてユーマの犯行に見せかけようとするが、死に神ちゃんの力で生み出された謎迷宮でユーマに完全に犯行を暴かれ、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
神父
カナイ区教会の神父。クギ男の正体であり、死に神ちゃんが生み出した謎迷宮でユーマが真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
信者
カナイ区教会の信者。クギ男の犯行に便乗し、クギ男の犯行に見せかけ美術館倉庫でイーソ=モエを殺害する。死に神ちゃんが生み出した謎迷宮でユーマが真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
カレン
エーテルア女学院演劇部在籍の生徒。半年前、口論の末アイコを殺害。アイコの仇討ちとして、アイコの友人だったヨシコ・ワルナ・クラネにより演劇の稽古で使うワイングラスに毒を塗られ、稽古中に毒を口にしてしまったため死亡した。
ワルナ
エーテルア女学院演劇部在籍の生徒。アイコの仇を討つため、ヨシコ・クラネと協力し、過去アイコを殺害したカレンに演劇で使うグラスに塗った毒を飲ませるよう仕向け稽古中に殺害。死に神ちゃんが生み出した謎迷宮でユーマが真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
ヨシコ
エーテルア女学院演劇部在籍の生徒。アイコの仇を討つため、ワルナ・クラネと協力し、過去アイコを殺害したカレンに演劇で使うグラスに塗った毒を飲ませるよう仕向け稽古中に殺害。死に神ちゃんが生み出した謎迷宮でユーマが真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
クラネ
エーテルア女学院演劇部在籍の生徒。アイコの仇を討つため、ヨシコ・ワルナと協力し、過去アイコを殺害したカレンに演劇で使うグラスに塗った毒を飲ませるよう仕向け稽古中に殺害。死に神ちゃんが生み出した謎迷宮でユーマが真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
シャチ
カナイ区ドーヤ地区に拠点を構えるレジスタンスのリーダー。保安部に追われて屋上に逃げた際に、待ち伏せしていたイカルディに銃で頭部を撃たれ死亡した。
イカルディ
カナイ区ドーヤ地区に拠点を構えるレジスタンスの幹部。マルノモン地区の金庫を奪うため、シャチの計画を乗っ取った上でシャチを殺害。シャチを自殺に見せかけるよう工作するが、ユーマが謎迷宮で真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
ウエスカ博士
アマテラス社地下研究所の研究主任。モニター越しに殺し屋に襲われたふりをしてユーマたちを研究室に誘き寄せようとするが、ユーマたちはアマたんを使ってセキュリティを突破しようと試み、エアロック室の通気口に潜んでいたヤコウがそれに乗り研究所までやって来る。ウエスカは耳が聞こえないため侵入に気づかず、ウエスカに恨みを持っていたヤコウにナイフで刺され死亡した。
ヤコウ=フーリオ
世界探偵機構の探偵。恋人を失った恨みからアマテラス社の地下研究所に籠るウエスカ博士の殺害を実行。殺し屋フィンクに殺害してもらうことも犯行の内だったので、ウエスカ殺害後にフィンクに刺されていく。瀕死状態の中、ユーマが謎迷宮で真相を解き明かしたため、死に神ちゃんに魂を狩られ死亡した。
すでに死亡しているキャラクター
スグマ=イーホ
カナイ区カマサキ地区の違法カジノのオーナー。運営するカジノで法外なレート勝負やイカサマが横行し恨みを買っていたようで、教会の森に名前を書かれ、半年前カジノでクギ男に殺害された。
アリ=ホアン
カナイ区ギンマ地区にある洋館の主。不動産売買で財を成すが、強引な地上げなどで恨みを買っていたようで、教会の森に名前を書かれ3ヶ月前洋館内でクギ男に殺害された。
イーソ=モエ
美貌を売りに多くの男性と関係を持っていた女。クギ男の一連の犯行に便乗した教会信者により、美術館倉庫でクギ男の犯行に見せかける形で殺害された。
アイコ
エーテルア女学院演劇部の生徒。半年前カレンと口論になり、カッとなったカレンにレンガで殴られ死亡した。